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关于 沉淀分离试剂盒 的几点质疑

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发表于 2015-10-27 09:32:34 | 显示全部楼层
本帖最后由 惜名 于 2015-10-27 09:35 编辑

终于,这个问题被正面提出了。我来搅几棍。
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鄙人实验室早期一直使用101bio,后来觉得步骤繁琐逐渐使用SBI。前段时间师兄投稿,被reviewer质疑(就是楼主写的那段话),我请Johhny用他们的超离方法帮我做过一次。因此,我算是3种方法都用过了。。。

先上我的干货:
1、101bio、SBI、超离,三种方法提的“exosome”我都做了功能实验,也就是用exo干预靶细胞、观察表型。三种方法得到了一样的结果。
2、来说说得到的exosome蛋白量,101bio和SBI得到的蛋白量差不多,但是这二者是超离的10-20倍左右。
3、pkh67-exo的摄取实验,我做了101bio和SBI的,都能看到靶细胞摄取pkh67-exo。
4、电镜:101bio得到的图是圆形空泡的(见我早期的帖子),SBI得到的是比较理想的图。当然,这个区别也可能是样本制备导致的。我前后做了5次电镜,深深觉得电镜室老师的样本制备技术是关键关键关键啊!!!

来说说那篇JoEV:Optimized exosome isolation protocol for cell culture supernatant and human plasma。在这篇文献中,头对头比较了SBI、exospin(不知道哪个公司的)、qEV和密度梯度离心4种方法的优劣。
粒子直径方面:SBI、exospin、qEV得到的直径、形态类似,但是和密度梯度相比多了些>200nm的颗粒
粒子数/每mg蛋白方面:以SBI为1单位,目测exospin、qEV、密度梯度分别为3、12、7,结合western跑蛋白marker的亮度,作者认为SBI提取的exo存在大量其他蛋白的污染。
上面的数据都是细胞上清中的exo,如果用血清来比较,SBI的数据更难看(声明:我和SBI无任何利益关系)

-----------------来个悲伤的分割线-------------------------
我做了3个和exo相关的小方向,其中1个已经投文章了(3.2分,求不要嘲笑)。另外2个正在做。静待reviewer是否会纠结我用的的方法。。。
当然,我已经想好了托辞:本文主要研究exo中的miRNA,因此蛋白污染即使有,也不影响我们对miRNA 的研究。我们可以在limitation中对所用方法进行讨论。

未来打算尝试下qEV,纵观hzangs的数据,和JoEV的结论,qEV的表现简直逆天(声明:我和IZON无任何利益关系)。

---“啥,你问我为啥不用超离?”
---“嗯,这个问题很好”
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