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楼主: 向荣y
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外泌体处理细胞

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发表于 2015-4-16 11:08:19 | 显示全部楼层
用外泌体干预细胞没有可参考的依据。你可以自己做个浓度梯度,在我看的有限的文献里,似乎都没有提外泌体浓度。
我个人经验,4ml上清提取的外泌体(DC来源),用200-400ul PBS重悬,然后用100ul干预一个孔(6孔板,HUVEC),是可以得到阳性结果的。
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发表于 2015-4-19 10:46:07 | 显示全部楼层
ffp1988 发表于 2015-4-18 10:09
您所说的10ug/ml是指??   外泌体的浓度?  怎么测出来的?

10ug/ml是指,每ml培养上清中加入10ug以蛋白衡量的外泌体。
这牵扯到一个外泌体浓度计算的问题,目前认为外泌体无法用Nano或电镜测浓度(或粒子数),文献多用蛋白量来间接反应外泌体浓度。
譬如,你有100ul PBS-exo,经裂解后测蛋白浓度,计算出这100ul PBS-exo共含有20ug蛋白(假设)。那么,这100ul PBS-exo加到六孔板中的1个孔(2ml培养基)中,即得到10ug/ml的外泌体干预浓度了。
-------------------
这里还有一个问题,10ug/ml的浓度只是相对你的实验体系而言的,因为目前认为不同的提取方法会导致exo纯度不一。例如有人认为kit提取的exo含有杂蛋白,这无疑会增加裂解后测得的蛋白浓度,因此使得不同提取方法之间的“外泌体浓度”没有可比性。
梯度密度离心法得到的exo或许目前认为是最纯的。
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发表于 2015-6-26 07:57:17 | 显示全部楼层
kadak007 发表于 2015-6-25 23:44
请教下,pbs-exo冻存于 --80℃,溶解后还能用来处理细胞吗?效果怎样呢?
谢谢~ ...

可以的,效果和新提的差不多,但是你不能在-80度放太久。
我个人经验,2-4周问题不大的。因为每次提出来量都很少,所以很快就用完了
也有人说可放数月。。。
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发表于 2015-7-1 08:22:11 | 显示全部楼层
kadak007 发表于 2015-6-30 15:42
处理细胞前,exo裂解后BCA测浓度,exo不裂解直接测浓度,这两种做法各有什么讲究吗?  ...

是否需要裂解这个问题我看到论坛里有人讨论过。。。
这个我也搞不清楚,反正我每次都是裂解的,不管是测浓度还是跑western
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发表于 2015-7-1 08:26:53 | 显示全部楼层
kadak007 发表于 2015-6-30 16:35
你好,请教下,做exo处理细胞时,每个孔里加多少细胞合适呢?总共需达到多大体积比较好呢?
譬如,25cm2规 ...

我做HUVEC(人脐静脉内皮细胞)的炎症反应,目测细胞密度50-95%的范围内都可以。
25cm2的瓶子面积为六孔板的2倍多一点,我手头的资料提示25cm2瓶子可以获得5*10^6个细胞,六孔板大约是2.5*10^。这样计算你1个瓶子分2个孔还是比较合适的。
当然,你能先摸一下条件是最好的。
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发表于 2015-7-2 10:02:24 | 显示全部楼层
kadak007 发表于 2015-7-2 00:43
非常感谢版主,完全取代了我老板的地位...... 我打算拿大鼠肌细胞试下
你做的实验 每个孔里exo加 ...

我用SBI提取的exo,得率之高令人乍舌。。。
所以我给出的浓度可能不是很准确,混杂了一些细胞培养液中的蛋白,供你参考吧。
大约每孔加50ul PBS-exo悬液,每ul约0.2ug。
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发表于 2015-7-3 16:40:37 | 显示全部楼层
kadak007 发表于 2015-7-3 16:23
惜名版主,用exo处理细胞,你有没有想过用小鼠源的细胞?毕竟后续功能实验时都得用小鼠的;
还是说,如果ex ...

有纠结过啊。。。
但是现实条件所限啊,人源的HUVEC是最常见、也是比较容易获得的。

如果做miRNA,其实人源和小鼠源序列几乎都是一样的
如果做蛋白,或许有点顾虑。
不过anyway,这是没办法的折中了。毕竟不求大paper,只求毕业。。。

P.S. 你要点回复我,我才能看到消息,否则我收不到你的提问。。。
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发表于 2015-7-8 10:54:36 | 显示全部楼层
梦想照进现实 发表于 2015-7-8 10:17
是否有文献支持~求文献细读,谢谢!

这篇Nature immunology <Exosomes mediate the cell-to-cell transmission of IFN-a-induced antiviral activity>,exo干预细胞基本都是用的5ug/ml;
这篇circulation <Circulating Exosomes Induced by Cardiac Pressure Overload Contain Functional Angiotensin II Type 1 Receptors>用的是exo粒子数定量。
这篇JACC <Plasma Exosomes Protect the Myocardium From Ischemia-Reperfusion Injury>同时用了粒子数和蛋白质量。

其实任何一篇关于exo的文章,你仔细去找找,大都能找到一些剂量。
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发表于 2015-7-21 08:49:04 | 显示全部楼层
本帖最后由 惜名 于 2015-7-21 08:54 编辑
kadak007 发表于 2015-7-20 20:56
版主,请指导下,PBS-exo处理细胞,你一般让它们共同孵育多久呢?按小时算,还是按天算? ...

这个恐怕得看你的exo通过什么途径发挥作用、以及你要检测什么。
--------------
如果你推测exo可以通过膜表面蛋白作用,那么时间应该是很快的,只要exo和细胞接触就可以作用了。然后你如果要检测mRNA表达,数小时就可以了。如果做蛋白,那就得16-24小时。
----------------
如果你推测exo是通过里面的miRNA作用,那么时间就得参照转染miRNA的了,例如,我看到的文献一般是在转染miRNA 36小时做检测。因为miRNA进到细胞还需要如靶序列结合、然后作用。
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