外泌体之家 | 细胞外膜泡领域核心平台—exosomes & microvesicles—小膜泡大作用

标题: 测序结果核糖体污染! [打印本页]

作者: 林剑邦    时间: 2016-12-30 14:07
标题: 测序结果核糖体污染!
  最近开展外泌体miRNA的研究,提取RNA后检测,结果显示样品核糖体污染,不知大家出现过这种情况吗?是细胞污染的原因吗,要如何避免呢?虚心向大家请教~谢谢!
  我猜想是我没有进行过滤处理,有可能是这个原因吗?

作者: hzangs    时间: 2016-12-30 14:57
根据一些做测序朋友的反馈。外泌体测序的时候确实会测到大约20%的数据是核糖体序列、
作者: baishixiaoyaozi    时间: 2016-12-31 02:50
hzangs 发表于 2016-12-30 14:57
根据一些做测序朋友的反馈。外泌体测序的时候确实会测到大约20%的数据是核糖体序列、 ...

我们实验室做过蛋白组分析,exosomes携带核糖体
作者: hzangs    时间: 2016-12-31 11:48
baishixiaoyaozi 发表于 2016-12-31 02:50
我们实验室做过蛋白组分析,exosomes携带核糖体

嗯嗯,  这个确实有paper报道的数据也显示 测序结果中有核糖体序列
作者: 微泡biomarker    时间: 2017-1-3 21:34
baishixiaoyaozi 发表于 2016-12-31 02:50
我们实验室做过蛋白组分析,exosomes携带核糖体

您好,请教一下大神怎么在外泌体的蛋白组学分析里面,分析出携带核糖体信息?
作者: baishixiaoyaozi    时间: 2017-1-3 23:19
微泡biomarker 发表于 2017-1-3 21:34
您好,请教一下大神怎么在外泌体的蛋白组学分析里面,分析出携带核糖体信息? ...

质谱分析检测到多个核糖体亚基蛋白,后续western blot进一步验证
作者: Marvel    时间: 2017-1-4 11:48
外泌体不是本身就是从核糖体源头分泌而来的吗,肯定是很多成分是核糖体吧




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